A Comexim Transportes nasceu com a diversificação das atividades do grupo, que até então se dedicava exclusivamente ao comércio e exportação de café. Hoje, dedica-se ao serviço de transporte de carga seca, basicamente carga fechada (origem/destino para apenas um cliente). Até pouco tempo, a Comexim Transportes prestava serviços também para terceiros, mas agora, com o aumento da demanda e a criação de novos segmentos no Grupo Comexim, a transportadora dedica-se exclusivamente às atividades do Grupo.