A Comexim Transportes nasceu no ano 2000, quando ainda tinha o nome Roma Transportes. Nesta época, com apenas um caminhão, transportava apenas café verde em sacaria de 60 kg, e 90% de seus serviços eram prestados para a Comexim Café.
O foco no transporte de carga seca foi o pontapé inicial para a diversificação e expansão de seus serviços. Até o ano de 2004 a Transportadora Roma atendeu outros clientes além da Comexim. Contudo, em 2005, a Comexim adquire 50% da Transportadora Roma; e em 2007, adquire os 50% restantes, e passa a chamar-se Comexim Transportes.
Em 2009, a empresa concentra seus serviços nas necessidades do Grupo Comexim. Tem frota própria de 32 caminhões, e conta com mais 14 veículos de prestadores de serviços, a maior parte deles da marca Scania.
Hoje, a Comexim Transportes cresce e acompanha a ampliação do Grupo Comexim, tornando-o auto-suficiente em logística. Isto significa qualidade, seja na garantia da integridade da carga, seja na garantia de prazos de entrega, o que é fundamental para empresas que trabalham no sistema Just in time.